Jego odejście do Radomiaka jest o tyle zaskakujące, że od jego przejścia z Legii do Zagłębia na zasadzie transferu definitywnego minęły niecałe dwa tygodnie. Wychowanek warszawskiej Legii uznał, że po transferze do Zagłębia Piotra Polczaka ma nieco mniejsze szanse na grę i postanowił zmienić pracodawcę. Makowski liczy, że w nowym klubie będzie znacznie częściej występował na boisku - podało w oficjalnym komunikacie Zagłębie Sosnowiec.

Rafał Makowski dołączył do Zagłębia w trakcie rundy jesiennej sezonu 2017/2018. Przed wypożyczeniem do Sosnowca zdążył jeszcze zagrać w barwach Legii w eliminacjach Ligi Mistrzów. Jesienią 2017 grał na pozycji defensywnego pomocnika był podstawowym zawodnikiem sosnowieckiego zespołu. Zagrał wtedy w jedenastu ligowych meczach, z czego w dziewięciu w pierwszym składzie. Ostatnim jego jesiennym meczem było spotkanie w Bytowie, w którym zszedł w pierwszej połowie z powodu kłopotów zdrowotnych.

W rundzie wiosennej Makowski miał już nie grać w Zagłębiu, a jego wypożyczenie z Legii Warszawa miało zostać skrócone, ale ostatecznie zawodnik pozostał w klubie z Sosnowca, ale zmienił pozycję i został środkowym obrońcą. Przegrał jednak rywalizację z Arkadiuszem Jędrychem i Mateuszem Cichockim i jedyne dwa występy w pierwszym składzie zaliczył, gdy podstawowi stoperzy pauzowali za żółte kartki. Pięć razy wchodził na boisko w końcówkach meczów, gdy Zagłębie broniło korzystnego wyniku i zmieniało ustawienie na grę trójką środkowych obrońców.

Łącznie Rafał Makowski zagrał w Zagłębiu w 18 meczach w Nice I lidze i jednym spotkaniu Pucharu Polski. Strzelił jedną bramkę w wygranym 3:0 meczu z GKS-em Katowice.